Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sema3cQ62181 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema3cQ62181 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms