Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SspnQ62147 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms