Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga6Q61739 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms