Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HlxQ61670 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HlxQ61670 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HlxQ61670 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HlxQ61670 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HlxQ61670 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms