Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AcanQ61282 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AcanQ61282 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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