Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf4bQ61136 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf4bQ61136 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms