Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms