Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxf1Q61080 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms