Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usf1Q61069 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usf1Q61069 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usf1Q61069 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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