Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf3Q60980 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms