Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp7Q60973 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms