Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kpna1Q60960 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms