Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vdac1Q60932 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms