Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn2dQ60773 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkn2dQ60773 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms