Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha1Q60750 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms