Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a1Q60737 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms