Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samhd1Q60710 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms