Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brip1Q5SXJ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brip1Q5SXJ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms