Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myh1Q5SX40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myh1Q5SX40 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms