Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sco1Q5SUC9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms