Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp18Q5SSI6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp18Q5SSI6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms