Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zzef1Q5SSH7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zzef1Q5SSH7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms