Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sap30lQ5SQF8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sap30lQ5SQF8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms