Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps54Q5SPW0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps54Q5SPW0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms