Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmprss11eQ5S248 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss11eQ5S248 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms