Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms