Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim58Q5NCC9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim58Q5NCC9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms