Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Trim41Q5NCC3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trim41Q5NCC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trim41Q5NCC3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms