Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm12253Q5NC48 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm12253Q5NC48 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm12253Q5NC48 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm12253Q5NC48 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm12253Q5NC48 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm12253Q5NC48 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm12253Q5NC48 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm12253Q5NC48 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm12253Q5NC48 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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