Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ttf2Q5NC05 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf2Q5NC05 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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