Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms