Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vps41Q5KU39 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vps41Q5KU39 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms