Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms