Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Znf354cQ571J5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Znf354cQ571J5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Znf354cQ571J5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf354cQ571J5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Znf354cQ571J5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Znf354cQ571J5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Znf354cQ571J5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Znf354cQ571J5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Znf354cQ571J5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf354cQ571J5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Znf354cQ571J5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms