Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpjQ569L8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenpjQ569L8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms