Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms