Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

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Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Adamts18Q4VC17 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Adamts18Q4VC17 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms