Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc84Q4VA36 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms