Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC100530Q497J0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC100530Q497J0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms