Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930518I15RikQ3V2W7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms