Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms