Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc110Q3V125 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc110Q3V125 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc110Q3V125 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms