Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc43Q3V0L5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc43Q3V0L5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms