Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ankrd53Q3V0J4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd53Q3V0J4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms