Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr7Q3V0I2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr7Q3V0I2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr7Q3V0I2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr7Q3V0I2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr7Q3V0I2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr7Q3V0I2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms