Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ScimpQ3UU41 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms