Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox3Q3UT54 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms