Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc9Q3USL1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhdc9Q3USL1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms