Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TceancQ3US16 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TceancQ3US16 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms