Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acsf3Q3URE1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acsf3Q3URE1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms