Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E130208F15RikQ3UPV3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms